Dựa trên Đề án tuyển sinh của Hội đồng tuyển sinh trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch, mức học phí của mỗi sinh viên sẽ có sự khác nhau giữa các năm học hoặc các học kỳ. Bởi vì mức học phí còn phụ thuộc vào số lượng tín chỉ mà sinh viên đăng ký ở mỗi kỳ học. Cụ thể, đối với các ngành Y khoa, Dược học, Răng - Hàm - Mặt mức học phí dao động khoảng 55.200.000 VNĐ/năm học/sinh viên; các ngành còn lại có mức học phí dao động khoảng 31.640.000 VNĐ/năm học/sinh viên. Dưới đây là mức học phí cụ thể của từng ngành mà bạn có thể tham khảo:
STT Mã ngành Tên ngành Tổ hợp môn Học phí Ghi chú
1 7720101 Y khoa B00 55.200.000 Đại trà
2 7720201 Dược học B00 55.200.000 Đại trà
3 7720301 Điều dưỡng B00 31.640.000 Đại trà
4 7720401 Dinh dưỡng B00 31.640.000 Đại trà
5 7720501 Răng - Hàm - Mặt B00 55.200.000 Đại trà
6 7720601 Kỹ thuật xét nghiệm y học B00 31.640.000 Đại trà
7 7720602 Kỹ thuật hình ảnh y học B00 31.640.000 Đại trà
8 7720603 Kỹ thuật phục hồi chức năng B00 31.640.000 Đại trà
9 7720699 Khúc xạ nhãn khoa B00 31.640.000 Đại trà
10 7720701 Y tế công cộng B00 31.640.000 Đại trà
1
7720101
Y khoa
B00
55.200.000
Đại trà
2
B00
55.200.000
Đại trà
3
B00
31.640.000
Đại trà
4
B00
31.640.000
Đại trà
5
B00
55.200.000
Đại trà
6
B00
31.640.000
Đại trà
7
B00
31.640.000
Đại trà
8
B00
31.640.000
Đại trà
9
B00
31.640.000
Đại trà
10
B00
31.640.000
Đại trà
Bên cạnh đó, hằng năm, Trường còn trích 10% học phí để trao học bổng cho sinh viên có hoàn cảnh khó khăn, học giỏi để sinh viên có điều kiện đến trường. Ngoài ra, Trường còn có quỹ học bổng cố định là Học bổng khuyến học Dương Quang Trung dành cho sinh viên có hoàn cảnh khó khăn của Trường và nhiều chương trình Học bổng quốc tế khác như: Học bổng Đài Loan, Học bổng PHD của Đại học Curtin, Học bổng Fulbright, Học bổng Indonesia,...